屈公病與登革熱的主要差異在於病原病毒種類、症狀表現及後遺症。兩者皆由帶有病毒的埃及斑蚊及白線斑蚊叮咬傳播，但屈公病由屈公病毒（Chikungunya virus，屬Togaviridae科Alphavirus屬）引起，登革熱則由登革病毒（Dengue virus，屬Flavivirus屬）感染。

在症狀上，兩者均有發燒、頭痛、肌肉痛、皮疹等相似表現，但屈公病特別以劇烈且持續的關節痛著稱，尤其是手腳小關節，關節痛可持續數週至數年，且常伴隨倦怠感、結膜炎、腹瀉、畏光等非典型症狀。登革熱則較常出現出血傾向（如鼻出血、牙齦出血），且關節痛通常不會長期持續，重症時可能導致出血性休克，死亡率較屈公病高。

兩者的潛伏期與病毒血症期也略有不同：屈公病潛伏期約2至12天（常見4至8天），病毒血症期為發病前2天至後5天；登革熱潛伏期約4至10天，病毒血症期為發病前1天至後5天。

治療方面，目前屈公病無特效抗病毒藥物，主要以支持療法為主，包括休息、補充水分及止痛退燒藥（避免阿斯匹靈），輕微活動有助於緩解關節僵硬。登革熱治療亦以支持療法為主，重症患者需密切醫療監控。

簡要比較如下：

項目 屈公病 登革熱
病原病毒 屈公病毒（Togaviridae科） 登革病毒（Flavivirus科）
傳播媒介 埃及斑蚊、白線斑蚊 埃及斑蚊、白線斑蚊
潛伏期 2-12天（常4-8天） 4-10天
主要症狀 突發高燒、劇烈關節痛（持續長久）、頭痛、倦怠、皮疹 高燒、頭痛、肌肉與關節痛、皮疹、出血傾向（鼻出血、牙齦出血）
關節痛持續性 可持續數週至數年 通常不持續長期
後遺症 長期關節痛、倦怠感 重症可能出血、休克
死亡率 極少致死 重症時死亡風險較高
治療 支持療法，無特效抗病毒藥物 支持療法，重症需醫療監控

此外，屈公病較少致死，但新生兒、長者及慢性病患者為重症高風險群，登革熱重症風險則與病毒型別及病情嚴重度相關。

所以，屈公病與登革熱雖同為蚊媒病毒感染，症狀有重疊，但屈公病以長期嚴重關節痛為特色，登革熱則以出血傾向及重症風險較高為主要區別。