水洗彩色筆的清洗效果良好且使用安全性高，主要因為其採用可水洗無毒顏料，能在皮膚、衣服、床單等多種材質上用清水、肥皂或一般洗衣劑輕鬆清洗，尤其在畫後4小時內清洗效果最佳；若時間較長，可用溫水浸泡並添加清潔劑加強清潔。此外，許多品牌的水洗彩色筆筆蓋設計有安全氣孔，防止孩童誤吞時窒息，且符合歐盟EN71-3及中國學生用品安全標準，保障使用安全。

在清洗方法上，除了用清水和肥皂外，對於較難清除的污漬，還可先用酒精、丙酮或揮發油打濕，再用肥皂液或洗衣粉搓洗，並用45℃～50℃溫水浸泡以提高清潔效果。

不過，水洗彩色筆的缺點包括顏色飽和度通常不如傳統彩色筆，顏色較淡雅，且多層上色時容易因顏料水溶性而造成顏色暈染或混合，對於追求鮮豔色彩和細膩漸層效果的使用者可能不理想。

綜合來看，水洗彩色筆非常適合兒童使用，因為它們安全無毒且易於清洗，但在專業或高彩度需求上可能有一定限制。