Fujifilm X-M5 的主要缺點包括無機身防抖、續航力較弱以及握持與操控問題。

無機身防抖

X-M5 取消了機身防抖功能。這在弱光環境或需要長時間曝光的情況下可能帶來不便。設計上，由於 X-M5 極端重視小體積，防抖機構所需的空間成為首個被捨棄的規格。使用者在拍攝時需要注意安全快門，尤其是搭配無防抖鏡頭時。雖然錄影時有電子防抖可用，但靜態拍攝仍無此功能。

續航力問題

X-M5 沿用 126S 電池，續航力較一般水準為弱。

握持與操控困擾

機身設計存在多個實際使用上的問題：

  • 機身尺寸與握持：機身較細小，握把位置較淺，手持時必須小心。體積過小導致握持方式受限。
  • 按鍵與轉盤設計：按鈕和撥輪過於細小緊迫，操控需格外小心。前轉盤特別靈敏，使用者容易誤觸而改變設定，導致光圈、軟片或 ISO 等參數意外改變。
  • 缺乏觀景窗：X-M5 未內建電子觀景窗。
  • 螢幕亮度不足：3 吋 104 萬點的側翻式觸控螢幕在戶外豔陽天時亮度略顯不足。
  • 其他設計缺陷：機底螺牙位置偏離光軸，搭配腳架時可能感到困擾；安裝原廠自拍棒或快拆板後，更換記憶卡和電池時底蓋會被擋住。