流感疫苗接種的適應症主要是年滿6個月以上的民眾，尤其建議以下族群接種以預防流感及其併發症：

  • 6個月以上的嬰幼兒
  • 孕婦
  • 5歲以下幼童
  • 65歲以上長者
  • 有慢性疾病或免疫力較弱者
  • 醫療及照護人員
  • 其他高風險族群

接種禁忌症包括：

  • 已知對流感疫苗成分有嚴重過敏反應者（例如對疫苗成分或蛋白質過敏）
  • 過去接種流感疫苗曾發生嚴重不良反應者
  • 未滿6個月嬰兒（因缺乏安全性及保護力資料）
  • 正在發燒或患有急性中重度疾病者，應待病情穩定後再接種
  • 鼻噴式活性減毒流感疫苗禁忌症：
    • 對疫苗成分（含蛋白質）有嚴重過敏反應者
    • 17歲以下有雷氏症候群病史或同時使用阿斯匹靈者
    • 嚴重免疫缺陷者（如白血病、淋巴瘤、HIV感染、使用高劑量免疫抑制劑者）
  • 哮喘或有喘鳴病史的2至4歲兒童不建議使用鼻噴式減活疫苗，應接種滅活疫苗

此外，對蛋過敏者一般仍可接種不活化流感疫苗，但建議接種後觀察30分鐘以上以防過敏反應。

所以，流感疫苗適用於6個月以上大多數人群，禁忌症主要是嚴重過敏反應、嚴重免疫缺陷、未滿6個月嬰兒及急性重病患者。不同疫苗型態（注射型與鼻噴型）禁忌症有所差異，接種前應諮詢醫師確認。