免費順編車牌與付費選號的主要差異在於費用、選號自由度與申請方式：

項目 免費順編車牌 付費選號車牌
費用 領牌費用較低或免費（約1250元基本費） 選號費用約2000元以上，標牌競標可達3000~6000元以上
選號自由度 車牌號碼由監理站依序隨機分配，無法指定號碼 可指定喜歡的號碼，包含熱門或吉利號碼，彈性較大
申請方式 需親自或委託到監理站現場排隊等待，現場依序領牌 可透過網路系統選號並線上繳費，省時方便
適合對象 對車牌號碼無特別要求，追求省時省錢者 重視車牌號碼，願意花費時間與金錢挑選者

具體來說，免費順編車牌是監理站依序發放的號碼，無法挑選，但可以選前三碼英文，且有「免錢選牌」的技巧，例如現場等待喜歡的號碼，只要當時沒人排隊即可領取。付費選號則是透過網路或標牌競標系統，車主可自行挑選心儀的號碼，流程較為便利且能確保拿到喜歡的號碼，但需支付較高費用。

所以，免費順編適合不在意號碼且希望節省費用的車主，付費選號則適合對車牌號碼有特別偏好且願意多花錢的車主。